Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ino80dQ66JY2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms