Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctnna3Q65CL1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctnna3Q65CL1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms