Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sdc3Q64519 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms