Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga3Q62470 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itga3Q62470 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms