Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms