Protein–RNA interactions for Protein: Q62226

Shh, Sonic hedgehog protein, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShhQ62226 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ShhQ62226 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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ShhQ62226 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ShhQ62226 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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