Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rbm38Q62176 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rbm38Q62176 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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