Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhocQ62159 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms