Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SspnQ62147 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SspnQ62147 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SspnQ62147 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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