Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cd47Q61735 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cd47Q61735 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cd47Q61735 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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