Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a4Q60857 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms