Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk1Q60855 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms