Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Csnk2a1Q60737 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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