Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5431Q5NCB3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms