Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scn2bQ56A07 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms