Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trp53i11Q4QQM4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trp53i11Q4QQM4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms