Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2al1nQ497L1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms