Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk4Q3V016 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk4Q3V016 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms