Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SvipQ3UZP4 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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