Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc114Q3UX62 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc114Q3UX62 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms