Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nr1d1Q3UV55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nr1d1Q3UV55 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms