Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx21Q3UR97 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms