Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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