Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rmdn3Q3UJU9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rmdn3Q3UJU9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms