Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnf44Q3UHJ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf44Q3UHJ8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms