Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Puf60Q3UEB3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Puf60Q3UEB3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms