Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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