Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TraddQ3U0V2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms