Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Palb2Q3U0P1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms