Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Fndc4Q3TR08 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Fndc4Q3TR08 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Fndc4Q3TR08 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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