Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf3c3Q3TMP1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf3c3Q3TMP1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms