Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc13Q3TIR1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms