Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Treml4Q3LRV9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Treml4Q3LRV9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms