Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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