Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd300lgQ1ERP8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms