Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Myo3bQ1EG27 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Myo3bQ1EG27 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms