Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptcd3Q14C51 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptcd3Q14C51 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms