Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cass4Q08EC4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms