Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssrp1Q08943 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms