Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MitfQ08874 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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