Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms