Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NrepQ07475 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms