Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Siah2Q06986 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms