Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPINDOCQ05AH6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms