Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Thbs3Q05895 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms