Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sox12Q04890 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sox12Q04890 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms