Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms