Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Msx2Q03358 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msx2Q03358 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms