Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms