Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacna1cQ01815 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms